Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms