Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS04

TRBV6-7, T-cell receptor beta variable 6-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-7A0A0A0MS04 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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TRBV6-7A0A0A0MS04 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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TRBV6-7A0A0A0MS04 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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TRBV6-7A0A0A0MS04 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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TRBV6-7A0A0A0MS04 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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TRBV6-7A0A0A0MS04 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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TRBV6-7A0A0A0MS04 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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