Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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