Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms