Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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HDGFL3Q9Y3E1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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HDGFL3Q9Y3E1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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HDGFL3Q9Y3E1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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HDGFL3Q9Y3E1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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HDGFL3Q9Y3E1 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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HDGFL3Q9Y3E1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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HDGFL3Q9Y3E1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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