Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms