Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX6Q9UNH7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms