Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms