Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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