Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG3Q9UJ98 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
STAG3Q9UJ98 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms