Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms