Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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