Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms