Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM30AQ9NV96 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms