Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms