Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms