Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms