Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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USP29Q9HBJ7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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USP29Q9HBJ7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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USP29Q9HBJ7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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