Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.05■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms