Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CEP44Q9C0F1 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms