Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM5Q9C035 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms