Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TINF2Q9BSI4 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms