Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FYCO1Q9BQS8 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms