Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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CLDN23Q96B33 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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CLDN23Q96B33 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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CLDN23Q96B33 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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CLDN23Q96B33 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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CLDN23Q96B33 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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