Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDAQ92838 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDAQ92838 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDAQ92838 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDAQ92838 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDAQ92838 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDAQ92838 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDAQ92838 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDAQ92838 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDAQ92838 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms