Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms