Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms