Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBRM1Q86U86 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBRM1Q86U86 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms