Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SNX20Q7Z614 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SNX20Q7Z614 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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