Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms