Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms