Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms