Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP170Q5SW79 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP170Q5SW79 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms