Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms