Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CEP89-207ENST00000591863 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 MVP-201ENST00000357402 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 NPHS1-202ENST00000378910 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ANKUB1-202ENST00000462519 2222 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 C14orf119-201ENST00000319074 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 OSBP2-208ENST00000437268 3580 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC018512.1-201ENST00000417761 2326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms