Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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