Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms