Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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RTL8BQ17RB0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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RTL8BQ17RB0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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