Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 332.8 ms