Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms