Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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