Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FXNQ16595 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms