Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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RPE65Q16518 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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RPE65Q16518 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RPE65Q16518 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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RPE65Q16518 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RPE65Q16518 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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