Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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GABRA6Q16445 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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GABRA6Q16445 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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GABRA6Q16445 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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GABRA6Q16445 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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GABRA6Q16445 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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GABRA6Q16445 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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