Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms