Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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