Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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