Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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