Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNHIT3Q15649 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNHIT3Q15649 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms