Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms